Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCA5O60264 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms