Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP9O43818 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP9O43818 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP9O43818 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP9O43818 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP9O43818 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP9O43818 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP9O43818 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP9O43818 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP9O43818 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP9O43818 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP9O43818 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP9O43818 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP9O43818 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP9O43818 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRP9O43818 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRP9O43818 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP9O43818 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP9O43818 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP9O43818 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP9O43818 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP9O43818 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP9O43818 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP9O43818 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP9O43818 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP9O43818 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP9O43818 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP9O43818 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRP9O43818 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRP9O43818 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRP9O43818 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRP9O43818 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RRP9O43818 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP9O43818 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP9O43818 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP9O43818 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP9O43818 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP9O43818 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP9O43818 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RRP9O43818 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP9O43818 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP9O43818 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP9O43818 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP9O43818 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP9O43818 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP9O43818 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP9O43818 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP9O43818 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP9O43818 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP9O43818 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP9O43818 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP9O43818 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP9O43818 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP9O43818 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRP9O43818 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP9O43818 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRP9O43818 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms