Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTN4O43707 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTN4O43707 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms