Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B1O43520 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP8B1O43520 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP8B1O43520 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms