Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAD51CO43502 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms