Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXC11O43248 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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HOXC11O43248 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC11O43248 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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