Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DYNC1LI2O43237 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DYNC1LI2O43237 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DYNC1LI2O43237 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DYNC1LI2O43237 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DYNC1LI2O43237 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DYNC1LI2O43237 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DYNC1LI2O43237 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DYNC1LI2O43237 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DYNC1LI2O43237 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DYNC1LI2O43237 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
DYNC1LI2O43237 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DYNC1LI2O43237 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms