Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEFVO15553 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEFVO15553 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEFVO15553 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEFVO15553 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEFVO15553 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEFVO15553 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEFVO15553 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEFVO15553 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEFVO15553 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEFVO15553 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEFVO15553 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEFVO15553 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEFVO15553 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEFVO15553 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEFVO15553 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEFVO15553 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEFVO15553 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEFVO15553 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEFVO15553 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEFVO15553 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEFVO15553 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEFVO15553 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MEFVO15553 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEFVO15553 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEFVO15553 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEFVO15553 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEFVO15553 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEFVO15553 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEFVO15553 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MEFVO15553 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEFVO15553 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEFVO15553 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEFVO15553 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEFVO15553 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEFVO15553 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEFVO15553 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEFVO15553 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEFVO15553 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEFVO15553 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEFVO15553 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEFVO15553 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEFVO15553 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEFVO15553 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEFVO15553 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEFVO15553 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEFVO15553 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEFVO15553 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEFVO15553 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEFVO15553 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEFVO15553 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEFVO15553 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEFVO15553 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEFVO15553 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEFVO15553 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEFVO15553 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEFVO15553 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEFVO15553 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEFVO15553 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEFVO15553 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEFVO15553 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEFVO15553 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEFVO15553 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEFVO15553 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEFVO15553 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms