Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLR1CO15160 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms