Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms