Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYNMO15061 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYNMO15061 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYNMO15061 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYNMO15061 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYNMO15061 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYNMO15061 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
SYNMO15061 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
SYNMO15061 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.57
SYNMO15061 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYNMO15061 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYNMO15061 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYNMO15061 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
SYNMO15061 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYNMO15061 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYNMO15061 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYNMO15061 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNMO15061 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNMO15061 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNMO15061 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNMO15061 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNMO15061 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNMO15061 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNMO15061 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNMO15061 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNMO15061 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNMO15061 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNMO15061 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYNMO15061 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYNMO15061 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYNMO15061 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYNMO15061 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYNMO15061 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYNMO15061 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYNMO15061 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SYNMO15061 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNMO15061 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNMO15061 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNMO15061 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNMO15061 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNMO15061 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNMO15061 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNMO15061 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNMO15061 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNMO15061 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNMO15061 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SYNMO15061 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYNMO15061 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYNMO15061 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYNMO15061 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SYNMO15061 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SYNMO15061 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SYNMO15061 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SYNMO15061 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SYNMO15061 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SYNMO15061 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SYNMO15061 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SYNMO15061 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SYNMO15061 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYNMO15061 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYNMO15061 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYNMO15061 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYNMO15061 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYNMO15061 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SYNMO15061 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNMO15061 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNMO15061 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNMO15061 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNMO15061 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNMO15061 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SYNMO15061 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNMO15061 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNMO15061 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNMO15061 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNMO15061 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNMO15061 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNMO15061 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SYNMO15061 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNMO15061 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNMO15061 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNMO15061 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms