Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSP2O14595 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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CTDSP2O14595 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSP2O14595 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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