Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOCS6O14544 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOCS6O14544 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOCS6O14544 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOCS6O14544 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOCS6O14544 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOCS6O14544 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOCS6O14544 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOCS6O14544 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SOCS6O14544 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOCS6O14544 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SOCS6O14544 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SOCS6O14544 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SOCS6O14544 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms