Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLIM4O00461 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms