Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H7C1H1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H7C1H1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H7C1H1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H7C1H1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H7C1H1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H7C1H1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H7C1H1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H7C1H1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H7C1H1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H7C1H1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H7C1H1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H7C1H1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H7C1H1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H7C1H1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H7C1H1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H7C1H1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H7C1H1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H7C1H1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H7C1H1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H7C1H1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H7C1H1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H7C1H1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H7C1H1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H7C1H1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms