Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8SH3BPF8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOLGA8SH3BPF8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms