Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C6orf229H3BNL8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms