Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UPK3BL2E5RIL1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UPK3BL2E5RIL1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPK3BL2E5RIL1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPK3BL2E5RIL1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPK3BL2E5RIL1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPK3BL2E5RIL1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UPK3BL2E5RIL1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms