Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HHLA1C9JL84 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HHLA1C9JL84 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms