Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PATL2C9JE40 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PATL2C9JE40 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms