Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERVV-1B6SEH8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERVV-1B6SEH8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms