Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CYSRT1A8MQ03 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CYSRT1A8MQ03 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms