Protein–RNA interactions for Protein: A8K010

LINC00473, Putative transcriptional regulator encoded by LINC00473, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00473A8K010 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00473A8K010 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00473A8K010 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms