Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GLTPD2A6NH11 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLTPD2A6NH11 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms