Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01546A6NGU7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms