Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA6L4A6NEF3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms