Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL33A6NCF5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
KLHL33A6NCF5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms