Protein–RNA interactions for Protein: A6BM72

MEGF11, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF11A6BM72 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MEGF11A6BM72 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MEGF11A6BM72 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MEGF11A6BM72 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MEGF11A6BM72 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MEGF11A6BM72 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MEGF11A6BM72 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms