Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF22A3QJZ6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF22A3QJZ6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms