Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA8A3KMH1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms