Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRGMA1A4Y4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IRGMA1A4Y4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms