Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CDRT1-202ENST00000354433 1557 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 FPR2-201ENST00000340023 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 SCNN1B-201ENST00000307331 2085 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 CSE1L-201ENST00000262982 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 DCANP1-201ENST00000503143 3135 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AL031009.1-201ENST00000624137 2182 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 SPDL1-201ENST00000265295 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 CEACAM19-201ENST00000358777 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 ADGRF3-201ENST00000311519 3240 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 ATP2A1-202ENST00000395503 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 NOP2-223ENST00000620535 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 IFT43-202ENST00000314067 833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 KCNIP1-202ENST00000377360 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 HNRNPH1P1-201ENST00000403291 1185 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 GSTK1-205ENST00000443571 850 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 BTN2A2-209ENST00000482536 1068 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AC010275.1-201ENST00000504081 565 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AC122719.2-201ENST00000511936 420 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AC137579.1-201ENST00000519978 836 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AP003392.3-201ENST00000531886 667 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 RAD51-AS1-203ENST00000533146 718 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AC010203.2-201ENST00000550886 418 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AP001877.1-201ENST00000611253 484 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 LINC02371-201ENST00000613818 567 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AL139035.1-202ENST00000626308 565 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 LINC00595-210ENST00000634452 562 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 TNNT3-217ENST00000641225 877 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 SCG2-201ENST00000305409 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 Z97192.1-201ENST00000391625 3894 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 KY-201ENST00000423778 2345 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 PPARGC1B-204ENST00000403750 3146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 SNHG3-202ENST00000437681 2614 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 IP6K2-219ENST00000446860 1565 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 TYK2-202ENST00000524462 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 ZNF503-AS1-201ENST00000416398 1860 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 CTAGE16P-201ENST00000435601 2412 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 PPHLN1-205ENST00000395568 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 NFXL1-206ENST00000507489 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 FAM153B-201ENST00000253490 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 LINC00589-201ENST00000506121 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 LINC01278-204ENST00000609143 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 ADIPOR2-201ENST00000357103 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 EFCAB12-201ENST00000326085 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 EFCAB12-204ENST00000505956 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 DGCR2-205ENST00000537045 4361 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 ZNF540-210ENST00000592533 3147 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 PLAUR-202ENST00000339082 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 IGHV4-28-201ENST00000390612 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 RPL23P11-201ENST00000418077 411 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 AC006450.1-201ENST00000421041 460 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 LINC00454-201ENST00000425483 503 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AC018693.2-201ENST00000435255 530 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AC118758.1-201ENST00000448242 564 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PTPRJQ12913 RN7SL645P-201ENST00000496148 269 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 TRPT1-215ENST00000546089 684 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AC087190.3-201ENST00000562893 753 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AC100827.1-201ENST00000569853 382 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AC090826.3-201ENST00000611178 834 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 AC022558.3-201ENST00000616598 688 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 LINC01395-201ENST00000631195 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 FPGT-TNNI3K-206ENST00000557284 2855 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 EPC1-201ENST00000263062 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PTPRJQ12913 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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