Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CSPG4P3Y-201ENST00000418188 3724 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 GANAB-215ENST00000534779 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 C2orf88-201ENST00000340623 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 PTPN2-201ENST00000309660 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RNLS-202ENST00000371947 3385 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 GCA-204ENST00000437150 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 KCNJ3-203ENST00000544049 4523 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 OR6N1-201ENST00000335094 1027 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 HSPB11-204ENST00000371378 894 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 PPIL3-202ENST00000392283 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 KRTAP10-6-201ENST00000400368 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AL022722.1-201ENST00000406333 582 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 PPIL3-204ENST00000409361 897 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 PDCD4-AS1-201ENST00000420367 778 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AL772202.1-201ENST00000421482 391 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 ADORA2BP1-201ENST00000429195 842 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 MAGI2-AS3-205ENST00000429408 634 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 ADH5P4-201ENST00000433151 1110 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 ANKRD20A11P-205ENST00000442192 920 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RN7SL164P-201ENST00000482613 303 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 PINX1-203ENST00000519088 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 IGLV3-2-201ENST00000519345 229 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 SFTPC-206ENST00000522109 921 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 HNRNPCP6-201ENST00000525816 871 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AP000759.1-201ENST00000531086 397 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 C12orf54-203ENST00000548364 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AL049836.1-201ENST00000553270 539 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AL132709.1-205ENST00000556136 551 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 ZNF415-221ENST00000600574 563 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AP000345.2-201ENST00000608615 1081 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AL121845.4-201ENST00000613401 306 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AL669831.6-201ENST00000635557 837 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 UROD-222ENST00000636836 1173 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 PRAMEF34P-201ENST00000611860 1447 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 PRAMEF7-201ENST00000330881 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 CYP8B1-202ENST00000437102 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 DNMBP-AS1-202ENST00000434409 2034 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 TLR5-201ENST00000366881 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 SNHG1-206ENST00000537925 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 PCDHGB5-201ENST00000617380 4578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 ZKSCAN3-201ENST00000252211 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 GPR85-204ENST00000449591 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 C1orf147-201ENST00000367119 2096 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PTPRJQ12913 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 SLC25A19-201ENST00000320362 1651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PTPRJQ12913 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PTPRJQ12913 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 LY6G5B-207ENST00000375864 2654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 DENND2A-210ENST00000537639 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 IL18-201ENST00000280357 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PTPRJQ12913 SOX2-OT-212ENST00000491282 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PTPRJQ12913 METTL23-213ENST00000591571 585 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC245884.8-201ENST00000599382 880 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 MYO5BP1-201ENST00000610994 1239 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC007786.2-201ENST00000618791 803 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 FP236240.4-201ENST00000624353 373 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC073488.4-201ENST00000632688 757 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 LINC01529-207ENST00000637448 810 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 CDKL2-202ENST00000429927 3383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 RPS6KB1-202ENST00000393021 5479 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 C11orf54-214ENST00000540113 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 AC009120.6-201ENST00000616116 1460 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 CHAMP1-201ENST00000361283 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 TNNT2-224ENST00000509001 1330 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 MARCH8-202ENST00000395769 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 ZNF16-209ENST00000611477 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PTPRJQ12913 ALK-207ENST00000642122 2513 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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