Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 NEAT1_1.1-201ENST00000620348 120 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 GAGE2E-201ENST00000621907 403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 PTPN7-219ENST00000629151 437 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AL160408.6-201ENST00000632063 1257 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AL137785.1-201ENST00000637466 490 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 DRGX-201ENST00000374139 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 C17orf75-202ENST00000577809 1642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 FAM92A-206ENST00000518322 4241 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AC002519.1-201ENST00000570073 2792 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 FCRL3-202ENST00000368186 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 KRBA1-203ENST00000485033 3434 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 MPP2-221ENST00000625880 4668 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 USP20-203ENST00000372429 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 ELP2-201ENST00000350494 2487 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 CA13-201ENST00000321764 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 TUBGCP5-205ENST00000615383 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 N4BP2L1-202ENST00000380130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 PTPN20-207ENST00000395725 2226 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 TUSC5-201ENST00000333813 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 ZNF213-AS1-204ENST00000572691 3232 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 UGT1A8-201ENST00000373450 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 CYP1A1-209ENST00000612821 2402 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 ARHGAP17-202ENST00000303665 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 YEATS4-201ENST00000247843 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 VIPAS39-211ENST00000557658 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 GOSR2-237ENST00000640443 3929 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 PACSIN1-201ENST00000244458 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 PACSIN1-202ENST00000374043 4229 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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