Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PNMA6F-201ENST00000436629 3348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AL353611.2-201ENST00000625008 2897 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 CH25H-201ENST00000371852 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 LINC02267-201ENST00000513393 1687 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AC004801.4-201ENST00000546738 3112 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 PAAF1-210ENST00000541951 1383 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 RBM12B-208ENST00000627241 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AP1S2-202ENST00000380291 3492 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 TTC23-204ENST00000394135 2496 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 PCDHAC1-201ENST00000253807 5299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 TMEM81-201ENST00000367167 1332 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 RNASE4-202ENST00000555597 1341 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AC011479.3-201ENST00000594299 1890 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 CBWD3-206ENST00000478048 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 HHAT-206ENST00000537898 3446 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 CMTM2-201ENST00000268595 1054 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 KRTAP13-1-201ENST00000355459 749 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 IGLV1-50-201ENST00000390291 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AL353133.2-201ENST00000402173 411 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AC074397.1-201ENST00000418013 1010 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 TXNDC9-205ENST00000434323 733 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AC011290.1-201ENST00000439751 414 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 CFL1P2-201ENST00000440986 684 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 SUB1-213ENST00000515355 771 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 SLA-206ENST00000517648 896 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AL359220.1-201ENST00000554086 781 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 RN7SL451P-201ENST00000583026 299 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AC005154.1-231ENST00000583664 431 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AC009271.1-201ENST00000589440 518 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 KRT25-201ENST00000312150 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 HPS1-204ENST00000361490 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 GABBR1-201ENST00000355973 3506 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 METTL2B-201ENST00000262432 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 UQCC1-201ENST00000349714 2188 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 TIGAR-204ENST00000635110 3633 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 RPL15-210ENST00000456530 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 EFCAB6-AS1-201ENST00000431327 2656 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 TDG-201ENST00000266775 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 LACC1-201ENST00000325686 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 ATAT1-203ENST00000329992 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 EPB41L4A-201ENST00000261486 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 GAGE12D-201ENST00000405679 527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 GAGE12C-201ENST00000420398 527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 GAGE12G-201ENST00000445148 527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PTPRJQ12913 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 ALG1L13P-201ENST00000518201 521 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 APOC1P1-204ENST00000575148 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AURKB-204ENST00000578549 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 AP000897.2-202ENST00000579332 821 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 SMIM6-202ENST00000579469 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 ZNF544-203ENST00000594384 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPRJQ12913 GAGE13-201ENST00000612958 530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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