Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARL2-SNX15V9GYD0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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