Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN6Q9Y6Q1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN6Q9Y6Q1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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