Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA3Q9Y6H8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms