Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB4Q9Y5E5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms