Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG4BQ9Y4P1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms