Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFE2L3Q9Y4A8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFE2L3Q9Y4A8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
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