Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TRAPPC8Q9Y2L5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms