Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms