Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNQ9UQP3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNQ9UQP3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNQ9UQP3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms