Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC3Q9UQE7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMC3Q9UQE7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms