Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN6Q9UQ52 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN6Q9UQ52 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms