Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN72

PCDHA7, Protocadherin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA7Q9UN72 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHA7Q9UN72 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHA7Q9UN72 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms