Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP45Q9UL16 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP45Q9UL16 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms