Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC2Q9UKJ5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CHIC2Q9UKJ5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms