Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RCAN3Q9UKA8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN3Q9UKA8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms